《仙剑奇侠传3》剧本为全新设定故事，使用的游戏引擎历时两年开发完成，其间大宇根据技术的进步和使用的回馈进行过多次重大调整，日臻完美成熟。

　　本作的故事发生在第一代的五十年前，那时侯李三思刚刚发出赤子的第一声啼哭，巫后还是襁褓中的婴儿，而剑圣则还没有拜入蜀山修仙。仙剑世界观的核心，就是构筑在中国上古神话和先民崇拜基础上的五灵六界体系，这些在仙剑一中有充分的体现，在仙剑三中，更成为整个故事的核心。